Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BICD1Q96G01 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BICD1Q96G01 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms