Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC59Q96AG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC59Q96AG4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms