Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BEST2Q8NFU1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BEST2Q8NFU1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms