Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms