Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RASSF3Q86WH2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RASSF3Q86WH2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms