Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP0

NIPA1, Magnesium transporter NIPA1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA1Q7RTP0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPA1Q7RTP0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA1Q7RTP0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms