Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC174Q6PII3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC174Q6PII3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms