Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTR9Q6PD62 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTR9Q6PD62 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms