Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEP350Q5VT06 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEP350Q5VT06 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms