Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC158Q5M9N0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC158Q5M9N0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms