Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZNF628Q5EBL2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF628Q5EBL2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms