Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDCA8Q53HL2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDCA8Q53HL2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms