Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 635.1 ms