Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HADHQ16836 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HADHQ16836 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms