Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RTN1Q16799 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTN1Q16799 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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