Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF239Q16600 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF239Q16600 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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