Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC18A3Q16572 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A3Q16572 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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