Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NPTX1Q15818 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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