Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPRKQ15262 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
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