Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCF4Q15080 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms