Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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