Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDK13Q14004 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK13Q14004 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK13Q14004 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
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