Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TUBA3CQ13748 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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