Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF1Q13351 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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