Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SP140Q13342 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SP140Q13342 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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SP140Q13342 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SP140Q13342 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SP140Q13342 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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