Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RBBP4Q09028 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms