Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GBE1Q04446 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GBE1Q04446 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms