Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF17Q02223 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms