Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POU5F1Q01860 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POU5F1Q01860 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms