Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP2C1P98194 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP2C1P98194 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms