Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG7P83436 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COG7P83436 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COG7P83436 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG7P83436 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COG7P83436 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COG7P83436 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COG7P83436 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COG7P83436 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms