Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NUP107P57740 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP107P57740 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP107P57740 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP107P57740 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP107P57740 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP107P57740 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms