Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
STX17P56962 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
STX17P56962 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
STX17P56962 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX17P56962 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX17P56962 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms