Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HADHBP55084 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HADHBP55084 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HADHBP55084 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HADHBP55084 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HADHBP55084 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HADHBP55084 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HADHBP55084 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HADHBP55084 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms