Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP3M2P53677 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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