Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
THOP1P52888 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
THOP1P52888 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
THOP1P52888 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
THOP1P52888 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
THOP1P52888 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
THOP1P52888 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
THOP1P52888 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
THOP1P52888 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms