Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRE11P49959 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRE11P49959 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRE11P49959 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRE11P49959 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms