Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFC5P40937 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFC5P40937 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFC5P40937 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFC5P40937 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFC5P40937 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms