Protein–RNA interactions for Protein: P38902

RPB11, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, yeastyeast

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11P38902 YDR262WYDR262W 819 nt0.49□□□□□ -2.33
RPB11P38902 MIC19YFR011C 513 nt0.49□□□□□ -2.33
RPB11P38902 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.49□□□□□ -2.33
RPB11P38902 GDS1YOR355W 1569 nt0.49□□□□□ -2.33
RPB11P38902 CDC24YAL041W 2565 nt0.49□□□□□ -2.33
RPB11P38902 YML002WYML002W 2214 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 ANS1YHR126C 480 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 YKL115CYKL115C 393 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 HYM1YKL189W 1200 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 YNL235CYNL235C 432 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 BRX1YOL077C 876 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 RRP15YPR143W 753 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 DCP2YNL118C 2913 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 SPT21YMR179W 2277 nt0.48□□□□□ -2.33
RPB11P38902 NUP145YGL092W 3954 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 SGO1YOR073W 1773 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 SHE9YDR393W 1371 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 CYC7YEL039C 342 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 IST3YIR005W 447 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 COX8YLR395C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 RPL9BYNL067W 576 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 IZH4YOL101C 939 nt0.47□□□□□ -2.33
RPB11P38902 PIP2YOR363C 2991 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 TMA22YJR014W 597 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RCN1YKL159C 636 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RUF20RUF20 443 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 IRC14YOR135C 342 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 GPX2YBR244W 489 nt0.46□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YDR248CYDR248C 582 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SMB1YER029C 591 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 KEG1YFR042W 603 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YLR031WYLR031W 561 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 CGI121YML036W 546 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 CLU1YMR012W 3834 nt0.45□□□□□ -2.34
RPB11P38902 MMS21YEL019C 804 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 PAM16YJL104W 450 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RFA3YJL173C 369 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 FMP23YBR047W 528 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 BRO1YPL084W 2535 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 NUP157YER105C 4176 nt0.44□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SWI6YLR182W 2412 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YDL009CYDL009C 324 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SNO3YFL060C 669 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YLR042CYLR042C 486 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RPL38YLR325C 237 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SNO2YNL334C 669 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RTC6YPL183W-A 282 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YBR090CYBR090C 369 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 GUP1YGL084C 1683 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RIM20YOR275C 1986 nt0.43□□□□□ -2.34
RPB11P38902 TOF2YKR010C 2316 nt0.42□□□□□ -2.34
RPB11P38902 DPB11YJL090C 2295 nt0.42□□□□□ -2.34
RPB11P38902 RPS10BYMR230W 318 nt0.42□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SHE4YOR035C 2370 nt0.42□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SLS1YLR139C 1932 nt0.42□□□□□ -2.34
RPB11P38902 MXR1YER042W 555 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 POP6YGR030C 477 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SEC22YLR268W 645 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 SMD2YLR275W 333 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 DDR48YMR173W 1293 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YBR051WYBR051W 351 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YBR224WYBR224W 516 nt0.41□□□□□ -2.34
RPB11P38902 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.4□□□□□ -2.35
RPB11P38902 LST4YKL176C 2487 nt0.39□□□□□ -2.35
RPB11P38902 RIO2YNL207W 1278 nt0.39□□□□□ -2.35
RPB11P38902 RKR1YMR247C 4689 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YDL073WYDL073W 2955 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 SVP26YHR181W 687 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YBR032WYBR032W 303 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YPL034WYPL034W 498 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 PEX34YCL056C 435 nt0.38□□□□□ -2.35
RPB11P38902 SWF1YDR126W 1011 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 PAU2YEL049W 363 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YGR265WYGR265W 411 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 BMT5YIL096C 1011 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 BLS1YLR408C 369 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YLL007CYLL007C 1998 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 PEP3YLR148W 2757 nt0.37□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YGR242WYGR242W 309 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 PHO80YOL001W 882 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YOR105WYOR105W 327 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 YDL206WYDL206W 2289 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 BI3Q0115 1554 nt0.36□□□□□ -2.35
RPB11P38902 UBP3YER151C 2739 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.3 ms