Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DSG3P32926 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DSG3P32926 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DSG3P32926 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DSG3P32926 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DSG3P32926 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DSG3P32926 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms