Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGFR3P22607 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGFR3P22607 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms