Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD44P16070 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD44P16070 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD44P16070 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD44P16070 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD44P16070 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD44P16070 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms