Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RGPD2P0DJD1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RGPD2P0DJD1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms