Protein–RNA interactions for Protein: P0C2J7

TY4B-H, Transposon Ty4-H Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-HP0C2J7 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 snR14snR14 160 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 MVP1YMR004W 1536 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YGR250CYGR250C 2346 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YJR029WYJR029W 5268 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YGL177WYGL177W 348 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YNR021WYNR021W 1215 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 NSL1YPL233W 651 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 MGR1YCL044C 1254 nt0.57□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 GIC2YDR309C 1152 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 VAB2YEL005C 849 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 RPL40AYIL148W 387 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YOR152CYOR152C 771 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 PPN1YDR452W 2025 nt0.56□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 SLD5YDR489W 885 nt0.55□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 COG7YGL005C 840 nt0.55□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YLR458WYLR458W 381 nt0.55□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 SLK19YOR195W 2466 nt0.55□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YDL157CYDL157C 357 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 BTN2YGR142W 1233 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 PRS3YHL011C 963 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 AZF1YOR113W 2745 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 ECM25YJL201W 1800 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 DAS1YJL149W 1992 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 BEM3YPL115C 3387 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 RGI1YER067W 486 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 MAM1YER106W 909 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 CSI2YOL007C 1026 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 AME1YBR211C 975 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 NUR1YDL089W 1455 nt0.54□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 DUO1YGL061C 744 nt0.53□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 RPI1YIL119C 1224 nt0.53□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 SAS3YBL052C 2496 nt0.53□□□□□ -2.32
TY4B-HP0C2J7 YJL114WYJL114W 681 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YOL150CYOL150C 312 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YDR338CYDR338C 2088 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 COX1Q0045 1605 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 KAR9YPL269W 1935 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 NCA2YPR155C 1851 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 GPI2YPL076W 843 nt0.52□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 HSK3YKL138C-A 210 nt0.51□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.51□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YBR051WYBR051W 351 nt0.51□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 SUT2YPR009W 807 nt0.51□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 MSC6YOR354C 2079 nt0.51□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 GIC1YHR061C 945 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YET2YMR040W 483 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YNL010WYNL010W 726 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 SMY1YKL079W 1971 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 SNA4YDL123W 423 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 COX6YHR051W 447 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 SDL1YIL167W 633 nt0.5□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 RLM1YPL089C 2031 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 NUP188YML103C 4968 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YLR031WYLR031W 561 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 TAP42YMR028W 1101 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 TIF11YMR260C 462 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 LSM7YNL147W 348 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 NTC20YBR188C 423 nt0.49□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 PRP39YML046W 1890 nt0.48□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YKE2YLR200W 345 nt0.48□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 FMP23YBR047W 528 nt0.48□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 CUR1YPR158W 759 nt0.48□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 PEX34YCL056C 435 nt0.48□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 FAR7YFR008W 666 nt0.47□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YNL226WYNL226W 411 nt0.47□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 SPP381YBR152W 876 nt0.47□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 BPH1YCR032W 6504 nt0.47□□□□□ -2.33
TY4B-HP0C2J7 YDR262WYDR262W 819 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 TMA20YER007C-A 546 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 RPL40BYKR094C 387 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 COF1YLL050C 432 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 FYV6YNL133C 522 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YBR224WYBR224W 516 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 MUK1YPL070W 1839 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YBP2YGL060W 1926 nt0.46□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 CCE1YKL011C 1062 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YMR178WYMR178W 825 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YOR376WYOR376W 369 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 COG8YML071C 1824 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 MUD2YKL074C 1584 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 FAR3YMR052W 615 nt0.45□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 STB6YKL072W 2301 nt0.44□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 SLX4YLR135W 2247 nt0.44□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YGL217CYGL217C 342 nt0.44□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 NEJ1YLR265C 1029 nt0.44□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 LSM4YER112W 564 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 IRC19YLL033W 693 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YML002WYML002W 2214 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YCR043CYCR043C 384 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YDR290WYDR290W 330 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 GOS1YHL031C 672 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YJR071WYJR071W 369 nt0.43□□□□□ -2.34
TY4B-HP0C2J7 YAL064WYAL064W 285 nt0.43□□□□□ -2.34
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