Protein–RNA interactions for Protein: O75874

IDH1, Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH1O75874 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IDH1O75874 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IDH1O75874 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IDH1O75874 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IDH1O75874 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IDH1O75874 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IDH1O75874 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IDH1O75874 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IDH1O75874 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IDH1O75874 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms