Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREB3O43889 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREB3O43889 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB3O43889 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB3O43889 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB3O43889 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREB3O43889 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREB3O43889 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3O43889 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3O43889 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms