Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LRRTM2O43300 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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