Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NEMP2A6NFY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEMP2A6NFY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms