Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC61Q9Y6R9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms