Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
R3HCC1Q9Y3T6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms